Susunan Organisasi Poltekkes terdiri atas :
| 1 | Direktur | Semuel Layuk, SKM, M.Kes |
| 2 | Pudir I | |
| 3 | Pudir II | Drs. Agus Rokot, S.Pd, M.Kes |
| 4 | Pudir III | Jane Kolompoy,SKM, M.Kes |
| 5 | Senat Poltekkes | |
| 6 | Kepala Sub Bagian ADAK | Getruida Alow,S.Pd, M.Kes |
| Kaur .Perencanaan & SIFO | Yohanis Tomastola, SST | |
| Kaur Akademik | Telly Mamuaya,S.Pd,M.Kes | |
| Kaur Kemahasiswaan | Semuel Tambuwun, SKM | |
| 7 | Kepala Sub Bagian ADUM | Dra. Rieke Arbie, M.Si |
| Kaur Umum & Keuangan | Sefrida Rumopa, SE | |
| Kaur Perlengkapan | Hayun RM | |
| Kaur Kepegawaian | Johanis Lombok | |
| Tenaga Fungsional | ||
| 8 | Ka. Unit Penelitian dan Pengabdian Masyarakat | Tony K. Timpua, S.Pd, M.Kes |
| 9 | Unsur Penunjang | |
| a. Ka. Unit Laboratorium | Nancy Losu, S.SiT | |
| b. Ka. Unit Perpustakaan | Adrian Tumiwa, S.Sos | |
| c. Ka. Unit Komputer | Yohanis Tomastola, SST | |
| d. Ka. Unit Bengkel | Zakarias Palloan, SST | |
| e. Ka. Unit Pemeliharaan & Perbaikan | Felix Kindangen | |
| f. Ka. Unit Asrama | Ketrina Konoralma, SKM | |
| 10 | Dewan Penyantun |